En bioinformatique, le neighbour joining est une méthode d'élaboration d'arbres de données phylogénétiques. La méthode Neighbour Joining se base sur les mêmes principes que les méthodes d'analyse de groupe (cluster analysis), telles que la méthode de UPGMA (qui se base sur les distances génétiques pour construire un arbre phylogénétique). La seule différence de la méthode de Neighbour Joining est qu'elle tient compte des différences de vitesse d'évolution entre les différentes branches de l'arbre phylogénétique. Cette méthode fournit un arbre non polarisé (non enraciné).